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Big Data Technology Accelerate Genomics Precision Medicine

机译:大数据技术加速基因组学精准医学

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摘要

During genomics life science research, the data volume of whole genomics andlife science algorithm is going bigger and bigger, which is calculated as TB,PB or EB etc. The key problem will be how to store and analyze the data withoptimized way. This paper demonstrates how Intel Big Data Technology andArchitecture help to facilitate and accelerate the genomics life scienceresearch in data store and utilization. Intel defines high performanceGenomicsDB for variant call data query and Lustre filesystem with HierarchalStorage Management for genomics data store. Based on these great technology,Intel defines genomics knowledge share and exchange architecture, which islanded and validated in BGI China and Shanghai Children Hospital with verypositive feedback. And these big data technology can definitely be scaled tomuch more genomics life science partners in the world.
机译:在基因组生命科学研究中,整个基因组和生命科学算法的数据量越来越大,以TB,PB或EB等计算。关键问题是如何以优化的方式存储和分析数据。本文演示了英特尔大数据技术和架构如何帮助促进和加速数据存储和利用中的基因组生命科学研究。英特尔通过用于基因组数据存储的HierarchalStorage Management为变体调用数据查询和Lustre文件系统定义了高性能GenomicsDB。基于这些伟大的技术,英特尔定义了基因组学知识共享和交换体系结构,该结构在BGI中国和上海儿童医院得到了肯定和积极的反馈。这些大数据技术绝对可以扩展到世界上更多的基因组生命科学合作伙伴。

著录项

  • 作者

    Li, Hao;

  • 作者单位
  • 年度 2017
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种
  • 中图分类

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